Περίληψη
Μια παθολογική επέκταση μιας μη κωδικοποιητικής εξανουκλεοτιδικής επανάληψης GGGGCC του γονιδίου C9orf72 έχει συσχετιστεί στενά με οικογενειακές περιπτώσεις αμυοτροφικής πλευρικής σκλήρυνσης (ALS) και μετωποκροταφικής εκφύλισης (FTD) κυρίως σε καυκάσιους πληθυσμούς. Την τελευταία δεκαετία, το επιστημονικό ενδιαφέρον είχε στραφεί στο γονίδιο αυτό και πολλές μελέτες που πραγματοποιήθηκαν έδειξαν πιθανή συσχέτιση και με άλλες νευροεκφυλιστικές νόσους. Πραγματοποιήσαμε εκτεταμένη βιβλιογραφική έρευνα για τη μετάλλαξη C9orf72 και τη συχνότητά της σε διάφορες νευρολογικές και ψυχιατρικές ασθένειες. Επιπλέον, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση των δεδομένων που σχετίζονται με την ALS και την οικογενή ALS. Αναπτύξαμε μια διαδικτυακή βάση δεδομένων που βασίζεται στο cloud και έναν διαδραστικό χάρτη. Η συνολική συχνότητα μετάλλαξης του C9orf72 είναι 20% για την οικογενή FTD, 16% για την οικογενή ALS και περίπου 6%-8% για τη σποραδική ALS και την FTD. Η επικαιροποιημένη μετα-ανάλυση που πραγματοποιήσαμε έδειξε ότι η συγκεντρωτική συχνότητα της επέκτασης της επανάληψης C9orf72 σε ασθενείς με οικογενή ALS ήταν 23% (CI: 18%-28%) και σε ασθενείς με σποραδική ALS 3% (CI: 3%-4%). Η ανάλυση υποομάδων όσον αφορά την καταγωγή του πληθυσμού αποκάλυψε σημαντικές διαφορές μεταξύ των καυκάσιων και των ασιατών ασθενών. Η ανάλυσή μας υποστηρίζει την άμεση αιτιώδη σχέση της επέκτασης C9orf72 στην ALS και την FTD. Αντιθέτως, ο ρόλος της C9orf72 σε άλλες νευροεκφυλιστικές διαταραχές παραμένει αμφιλεγόμενος. Το σύστημα που αναπτύξαμε -η διαδικτυακή βάση δεδομένων και ο διαδραστικός χάρτης- ελπίζουμε να αποτελέσει το εφαλτήριο για μια συνεχώς αναπτυσσόμενη πλατφόρμα που θα βοηθήσει επιστήμονες από όλο τον κόσμο να συμβάλουν στη μετα-ανάλυση των δημοσιεύσεων που σχετίζονται με την C9orf72.
Μια παθολογική επέκταση μιας μη κωδικοποιητικής εξανουκλεοτιδικής επανάληψης GGGGCC του γονιδίου C9orf72 έχει συσχετιστεί στενά με οικογενειακές περιπτώσεις αμυοτροφικής πλευρικής σκλήρυνσης (ALS) και μετωποκροταφικής εκφύλισης (FTD) κυρίως σε καυκάσιους πληθυσμούς. Την τελευταία δεκαετία, το επιστημονικό ενδιαφέρον είχε στραφεί στο γονίδιο αυτό και πολλές μελέτες που πραγματοποιήθηκαν έδειξαν πιθανή συσχέτιση και με άλλες νευροεκφυλιστικές νόσους. Πραγματοποιήσαμε εκτεταμένη βιβλιογραφική έρευνα για τη μετάλλαξη C9orf72 και τη συχνότητά της σε διάφορες νευρολογικές και ψυχιατρικές ασθένειες. Επιπλέον, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση των δεδομένων που σχετίζονται με την ALS και την οικογενή ALS. Αναπτύξαμε μια διαδικτυακή βάση δεδομένων που βασίζεται στο cloud και έναν διαδραστικό χάρτη. Η συνολική συχνότητα μετάλλαξης του C9orf72 είναι 20% για την οικογενή FTD, 16% για την οικογενή ALS και περίπου 6%-8% για τη σποραδική ALS και την FTD. Η επικαιροποιημένη μετα-ανάλυση που πραγματοποιήσαμε έδειξε ότι η συγκεντρωτική συχνότητα της επέκτασης της επανάληψης C9orf72 σε ασθενείς με οικογενή ALS ήταν 23% (CI: 18%-28%) και σε ασθενείς με σποραδική ALS 3% (CI: 3%-4%). Η ανάλυση υποομάδων όσον αφορά την καταγωγή του πληθυσμού αποκάλυψε σημαντικές διαφορές μεταξύ των καυκάσιων και των ασιατών ασθενών. Η ανάλυσή μας υποστηρίζει την άμεση αιτιώδη σχέση της επέκτασης C9orf72 στην ALS και την FTD. Αντιθέτως, ο ρόλος της C9orf72 σε άλλες νευροεκφυλιστικές διαταραχές παραμένει αμφιλεγόμενος. Το σύστημα που αναπτύξαμε -η διαδικτυακή βάση δεδομένων και ο διαδραστικός χάρτης- ελπίζουμε να αποτελέσει το εφαλτήριο για μια συνεχώς αναπτυσσόμενη πλατφόρμα που θα βοηθήσει επιστήμονες από όλο τον κόσμο να συμβάλουν στη μετα-ανάλυση των δημοσιεύσεων που σχετίζονται με την C9orf72.